無機物由電導率法來測定。電導率并不能反映出有機物和微生物等的含量。較低電導率的水中可能含有較高的有機物(反之亦然)。有機物，微生物，以及部分微粒，通過檢測TOC來反映。 總有機總有機碳分析儀碳的指標在一定意義上說明的是對水污染的監控。如果總有機碳控制在一個較低的水平上，意味著水中有機物、微生物及細菌內毒素的污染處于較好的受控狀態。這也是一些驗證資料中將總有機碳作為驗證項目的重要原因。有機碳進入水系統有幾個途徑。最常見的是從原水中帶進的。TOC的主要來源是生物物質，例如：動植物的腐爛，細菌活動，動物的排泄物。這些生物物質都會通過滲透入水井或溢流進湖泊和河流后進入市政自來水的水這些含TOC的產品的合成物分子量從低到高都有，低分子量的有甲醇，高分子量的有多環物質。有機物的另一個來源是工業廢水，殺蟲劑，除草劑，化學品。這些化合物的威力相當高，會引起嚴重的健康問題。在當地環保局和衛生局的指導下，大部分TOC通過凈化方法可以從原水中除去。細菌的污染，在某種程度上，存在于所有水系統，細菌的抑制會使TOC變大。不管TOC是何種來源，都需要在制藥用水系統中對TOC進行適當的測定，監控和控制。降低水中TOC濃度可通過預處理床，過濾或TOC降解裝置來進行。一些有效的過濾方法包括碳床，溶媒過濾和總有機碳分析儀反滲透膜過濾。在使用碳床過濾時，TOC可能和碳分子發生了反應，也可能滲入碳床了。普通的消費者用有一定品質保障的凈水設備完全能有效去除、降低水質TOC含量。傳統方法：經典的有干燒法、濕燒法等，但是這些測試方法始終停留在實驗室、專業機構、工業等領域，由于測試復雜、儀器大型且昂貴，所以普通消費者無法實時測試水質TOC。先把水中有機物的碳氧化成二氧化碳，消除干擾因素后由二氧化碳檢測器測定，再由數據處理把二氧化碳氣體含量轉換成水中有機物的濃度。經過不斷的研究實驗，TOC檢測方法從傳統的復雜技術漸漸變成便捷準確。該方法是在氧化之前經磷酸處理待測樣品 ,去除無機碳,而后測量 TOC的濃度。現代的TOC連續分析儀中，絕大部分都是濕法氧化。濕法氧化對于復雜的水體(例如:腐殖酸、高分子量化合物等)氧化不充分,所以不適用TOC含量高的水體,但是對于常規水體如地表水、常規海水還是可以的。